Other packages > Find by keyword >

tcpl  

ToxCast Data Analysis Pipeline
View on CRAN: Click here


Download and install tcpl package within the R console
Install from CRAN:
install.packages("tcpl")

Install from Github:
library("remotes")
install_github("cran/tcpl")

Install by package version:
library("remotes")
install_version("tcpl", "3.3.1")



Attach the package and use:
library("tcpl")
Maintained by
Jason Brown
[Scholar Profile | Author Map]
All associated links for this package
First Published: 2016-05-07
Latest Update: 2025-05-05
Description:
A set of tools for processing and modeling high-throughput and high-content chemical screening data. The package was developed for the the chemical screening data generated by the US EPA ToxCast program, but can be used for diverse chemical screening efforts.
How to cite:
Jason Brown (2016). tcpl: ToxCast Data Analysis Pipeline. R package version 3.3.1, https://cran.r-project.org/web/packages/tcpl. Accessed 06 Oct. 2026.
Previous versions and publish date:
(2026-07-09 07:12), 1.2.2 (2018-05-10 16:25), 1.2 (2016-05-07 02:07), 1.4.3 (2018-05-20 16:38), 2.0.0 (2018-11-10 17:20), 2.0.1 (2018-11-16 17:20), 2.0.2 (2019-07-26 16:50), 2.1.0 (2022-03-03 20:10), 3.0.0 (2022-08-31 10:40), 3.0.1 (2022-11-08 15:30), 3.1.0 (2023-10-06 21:50), 3.2.0 (2024-10-09 20:10), 3.2.1 (2025-04-09 09:30), 3.3.0 (2025-05-05 16:00)
Other packages that cited tcpl R package
View tcpl citation profile
Other R packages that tcpl depends, imports, suggests or enhances
Complete documentation for tcpl
Functions, R codes and Examples using the tcpl R package
Some associated functions: MC2_Methods . MC3_Methods . MC4_Methods . MC5_Methods . MC6_Methods . Models . SC1_Methods . SC2_Methods . assay_funcs . blineShift . chdat . check_tcpl_db_schema . config_funcs . dot-buildAssayQ . dot-convertNames . dot-load6DR . dot-plateHeat . dot-prepField . flareFunc . hill_utils . interlaceFunc . invitrodb_dd . is.odd . lu . lw . mc1 . mc2 . mc3 . mc4 . mc5 . mc6 . mc_vignette . mcdat . mthd_funcs . query_funcs . registerMthd . rgstr_funcs . sc1 . sc2 . sc_vignette . scdat . sink.reset . tcplAICProb . tcplAddModel . tcplAppend . tcplCascade . tcplCode2CASN . tcplCytoPt . tcplDefine . tcplDelete . tcplFit . tcplFit2 . tcplFit2_nest . tcplFit2_unnest . tcplGetAeid . tcplHit2 . tcplListFlds . tcplLoadChem . tcplLoadClib . tcplLoadConcUnit . tcplLoadData . tcplLoadUnit . tcplLvlCount . tcplMakeAeidMultiPlts . tcplMakeAeidPlts . tcplMakeChidMultiPlts . tcplMultiplot . tcplPlot . tcplPlotFitc . tcplPlotFits . tcplPlotM4ID . tcplPlotPlate . tcplPlotlyPlot . tcplPrepOtpt . tcplRun . tcplSubsetChid . tcplVarMat . tcplWriteData . tcplWriteLvl0 . tcpldbStats . tcplggplot . write_lvl_4 . 
Some associated R codes: Models.R . assay_funcs.R . attachFormals.R . blineShift.R . buildAssayQ.R . chemQueries.R . clearSQLite.R . config_funcs.R . convertNames.R . data.R . drawCircles.R . flareFunc.R . getConfFile.R . hill_utils.R . interlaceFunc.R . is.odd.R . load6DR.R . lu.R . lw.R . mc1.R . mc2.R . mc2_mthds.R . mc3.R . mc3_mthds.R . mc4.R . mc4_mthds.R . mc5.R . mc5_mthds.R . mc6.R . mc6_mthds.R . mthd_funcs.R . multProc.R . multiplotFit.R . onAttach.R . onLoad.R . plateHeat.R . plotCompareFit.R . plotFit.R . prepField.R . query_funcs.R . registerMthd.R . rgstr_funcs.R . sc1.R . sc1_mthds.R . sc2.R . sc2_mthds.R . sink.reset.R . tcplAICProb.R . tcplAddModel.R . tcplAppend.R . tcplCascade.R . tcplCode2CASN.R . tcplConf.R . tcplConfDefault.R . tcplConfExample.R . tcplConfList.R . tcplConfLoad.R . tcplConfReset.R . tcplConfSave.R . tcplCytoPt.R . tcplDefine.R . tcplDelete.R . tcplFit.R . tcplFit2.R . tcplGetAeid.R . tcplHillACXX.R . tcplHillConc.R . tcplHillVal.R . tcplListFlds.R . tcplLiteInit.R . tcplLoadAcid.R . tcplLoadAeid.R . tcplLoadAid.R . tcplLoadAsid.R . tcplLoadChem.R . tcplLoadClib.R . tcplLoadConcUnit.R . tcplLoadData.R . tcplLoadUnit.R . tcplLvlCount.R . tcplMakeAeidMultiPlts.R . tcplMakeAeidPlts.R . tcplMakeChidMultiPlts.R . tcplMthdAssign.R . tcplMthdClear.R . tcplMthdList.R . tcplMthdLoad.R . tcplMultiplot.R . tcplObjCnst.R . tcplObjGnls.R . tcplObjHill.R . tcplPlot.R . tcplPlotFitc.R . tcplPlotFits.R . tcplPlotM4ID.R . tcplPlotPlate.R . tcplPrepOtpt.R . tcplQuery.R . tcplRegister.R . tcplRun.R . tcplSendQuery.R . tcplSubsetChid.R . tcplUpdate.R . tcplVarMat.R . tcplWriteData.R . tcplWriteLvl0.R . tcpldbStats.R . v3_schema_functions.R .  Full tcpl package functions and examples
Downloads during the last 30 days

Today's Hot Picks in Authors and Packages

nextGenShinyApps  
Craft Exceptional 'R Shiny' Applications and Dashboards with Novel Responsive Tools
Nove responsive tools for designing and developing 'Shiny' dashboards and applications. The scripts ...
Download / Learn more Package Citations See dependency  
gRim  
Graphical Interaction Models
Provides the following types of models: Models for contingency tables (i.e. log-linear models) Grap ...
Download / Learn more Package Citations See dependency  
gecko  
Geographical Ecology and Conservation Knowledge Online
Includes a collection of geographical analysis functions aimed primarily at ecology and conservation ...
Download / Learn more Package Citations See dependency  

28,905

R Packages

247,686

Dependencies

76,495

Author Associations

28,906

Publication Badges

© Copyright since 2022. All right reserved, rpkg.net.  Based in Cambridge, Massachusetts, USA