Other packages > Find by keyword >

vegan  

Community Ecology Package
View on CRAN: Click here


Download and install vegan package within the R console
Install from CRAN:
install.packages("vegan")

Install from Github:
library("remotes")
install_github("cran/vegan")

Install by package version:
library("remotes")
install_version("vegan", "2.6-8")



Attach the package and use:
library("vegan")
Maintained by
Jari Oksanen
[Scholar Profile | Author Map]
First Published: 2001-09-06
Latest Update: 2022-10-11
Description:
Ordination methods, diversity analysis and other functions for community and vegetation ecologists.
How to cite:
Jari Oksanen (2001). vegan: Community Ecology Package. R package version 2.6-8, https://cran.r-project.org/web/packages/vegan. Accessed 09 Jan. 2025.
Previous versions and publish date:
1.0-1 (2001-09-06 11:12), 1.2-0 (2001-11-19 07:43), 1.2-1 (2001-12-18 10:54), 1.4-0 (2002-05-03 16:10), 1.4-1 (2002-10-04 08:52), 1.4-2 (2003-02-07 13:50), 1.4-3 (2003-04-22 18:18), 1.4-4 (2003-05-19 11:56), 1.6-0 (2003-10-20 22:05), 1.6-1 (2003-12-12 13:22), 1.6-2 (2004-01-22 15:04), 1.6-3 (2004-03-22 12:35), 1.6-4 (2004-06-11 10:51), 1.6-5 (2004-10-13 19:14), 1.6-6 (2005-01-09 22:47), 1.6-7 (2005-01-25 10:17), 1.6-8 (2005-04-18 10:20), 1.6-9 (2005-04-22 13:46), 1.6-10 (2005-09-26 17:30), 1.8-1 (2006-06-12 11:50), 1.8-2 (2006-06-14 13:14), 1.8-3 (2006-09-29 13:48), 1.8-4 (2007-01-08 20:55), 1.8-5 (2007-01-11 20:41), 1.8-6 (2007-05-10 09:10), 1.8-7 (2007-08-25 18:53), 1.8-8 (2007-10-03 12:05), 1.11-0 (2008-02-21 20:59), 1.11-2 (2008-03-21 20:28), 1.11-3 (2008-04-10 15:35), 1.11-4 (2008-04-24 08:40), 1.13-0 (2008-05-21 18:26), 1.13-1 (2008-06-11 11:16), 1.13-2 (2008-08-20 14:14), 1.15-0 (2008-09-30 11:26), 1.15-1 (2008-12-19 11:56), 1.15-2 (2009-04-15 15:51), 1.15-3 (2009-06-17 14:05), 1.15-4 (2009-09-07 15:03), 1.17-0 (2010-01-11 19:10), 1.17-1 (2010-02-18 14:05), 1.17-2 (2010-03-08 20:01), 1.17-3 (2010-06-16 17:08), 1.17-4 (2010-08-20 09:16), 1.17-5 (2010-12-18 08:07), 1.17-6 (2011-01-10 11:25), 1.17-7 (2011-02-16 13:08), 1.17-8 (2011-03-02 16:16), 1.17-9 (2011-03-31 17:19), 1.17-10 (2011-04-27 19:19), 1.17-11 (2011-06-15 20:13), 1.17-12 (2011-08-17 22:28), 2.0-0 (2011-09-08 08:02), 2.0-1 (2011-10-20 13:22), 2.0-2 (2011-11-15 18:09), 2.0-3 (2012-03-03 16:54), 2.0-4 (2012-06-19 11:32), 2.0-5 (2012-10-08 16:39), 2.0-6 (2013-02-11 14:26), 2.0-7 (2013-03-19 16:05), 2.0-8 (2013-07-10 16:36), 2.0-9 (2013-09-25 09:56), 2.0-10 (2013-12-12 11:32), 2.2-0 (2014-11-17 11:35), 2.2-1 (2015-01-12 14:18), 2.3-0 (2015-05-26 15:49), 2.3-1 (2015-09-25 16:36), 2.3-2 (2015-11-19 17:20), 2.3-3 (2016-01-12 11:59), 2.3-4 (2016-02-26 14:12), 2.3-5 (2016-04-09 00:53), 2.4-0 (2016-06-15 15:38), 2.4-1 (2016-09-07 14:41), 2.4-2 (2017-01-17 19:41), 2.4-3 (2017-04-07 14:27), 2.4-4 (2017-08-24 16:40), 2.4-5 (2017-12-01 18:54), 2.4-6 (2018-01-24 13:54), 2.5-1 (2018-04-14 17:09), 2.5-2 (2018-05-17 11:05), 2.5-3 (2018-10-25 10:00), 2.5-4 (2019-02-04 12:50), 2.5-5 (2019-05-12 16:50), 2.5-6 (2019-09-01 16:30), 2.5-7 (2020-11-28 16:10), 2.6-2 (2022-04-17 19:00), 2.6-4 (2022-10-11 14:40), 2.6-6.1 (2024-05-21 20:00), 2.6-6 (2024-05-14 09:40)
Other packages that cited vegan R package
View vegan citation profile
Other R packages that vegan depends, imports, suggests or enhances
Complete documentation for vegan
Functions, R codes and Examples using the vegan R package
Some associated functions: BCI . CCorA . MDSrotate . MOStest . RsquareAdj . SSarrhenius . add1.cca . adipart . adonis . anosim . anova.cca . avgdist . beals . betadisper . betadiver . bgdispersal . bioenv . biplot.rda . capscale . cascadeKM . cca . ccaject . clamtest . commsim . contribdiv . decorana . decostand . designdist . deviance.cca . dispindmorisita . dispweight . distconnected . diversity . dune . dune.taxon . eigenvals . envfit . eventstar . fisherfit . goodness.cca . goodness.metaMDS . indpower . influence.cca . isomap . kendall.global . linestack . make.cepnames . mantel.correlog . mantel . metaMDS . mite . monoMDS . mrpp . mso . multipart . nestedtemp . nobs.cca . nullmodel . oecosimu . ordiArrowTextXY . ordiarrows . ordihull . ordilabel . ordiplot . ordipointlabel . ordiresids . ordistep . ordisurf . orditkplot . orditorp . ordixyplot . pcnm . permatfull . permustats . permutations . permutest.betadisper . plot.cca . prc . predict.cca . procrustes . pyrifos . radfit . rankindex . rarefy . raupcrick . read.cep . renyi . reorder.hclust . scores . screeplot.cca . simper . simulate.rda . sipoo . spantree . specaccum . specpool . sppscores . stepacross . stressplot.wcmdscale . taxondive . tolerance . treedive . tsallis . varechem . varpart . vegan-defunct . vegan-deprecated . vegan-internal . vegan-package . vegdist . vegemite . wascores . wcmdscale . 
Some associated R codes: AIC.radfit.R . CCorA.R . GowerDblcen.R . MDSrotate.R . MOStest.R . RsquareAdj.R . SSarrhenius.R . SSgitay.R . SSgleason.R . SSlomolino.R . TukeyHSD.betadisper.R . add1.cca.R . adipart.R . adipart.default.R . adipart.formula.R . adonis-deprecated.R . adonis.R . alias.cca.R . anosim.R . anova.betadisper.R . anova.cca.R . anova.ccabyterm.R . anova.ccalist.R . anova.ccanull.R . anova.prc.R . as.fisher.R . as.hclust.spantree.R . as.mcmc.oecosimu.R . as.preston.R . as.rad.R . as.ts.oecosimu.R . as.ts.permat.R . avgdist.R . beals.R . betadisper.R . betadiver.R . bgdispersal.R . bioenv.R . bioenv.default.R . bioenv.formula.R . biplot.CCorA.R . biplot.rda.R . boxplot.betadisper.R . boxplot.specaccum.R . bstick.R . bstick.cca.R . bstick.decorana.R . bstick.default.R . bstick.prcomp.R . bstick.princomp.R . cIndexKM.R . calibrate.R . calibrate.cca.R . calibrate.ordisurf.R . capscale.R . cascadeKM.R . cca.R . cca.default.R . cca.formula.R . centroids.cca.R . checkSelect.R . clamtest.R . coef.cca.R . coef.radfit.R . coef.rda.R . commsim.R . confint.MOStest.R . contribdiv.R . cophenetic.spantree.R . coverscale.R . dbrda.R . decorana.R . decostand.R . designdist.R . deviance.cca.R . deviance.rda.R . dispindmorisita.R . dispweight.R . distconnected.R . diversity.R . downweight.R . drop1.cca.R . eigengrad.R . eigenvals.R . envfit.R . envfit.default.R . envfit.formula.R . estaccumR.R . estimateR.R . estimateR.data.frame.R . estimateR.default.R . estimateR.matrix.R . eventstar.R . extractAIC.cca.R . factorfit.R . fieller.MOStest.R . fisher.alpha.R . fisherfit.R . fitspecaccum.R . fitted.capscale.R . fitted.cca.R . fitted.dbrda.R . fitted.procrustes.R . fitted.radfit.R . fitted.rda.R . gdispweight.R . getPermuteMatrix.R . goodness.R . goodness.cca.R . goodness.metaMDS.R . head.summary.cca.R . hierParseFormula.R . hiersimu.R . hiersimu.default.R . hiersimu.formula.R . howHead.R . humpfit.R . identify.ordiplot.R . indpower.R . inertcomp.R . influence.cca.R . initMDS.R . intersetcor.R . isomap.R . isomapdist.R . kendall.global.R . kendall.post.R . labels.envfit.R . lines.permat.R . lines.prestonfit.R . lines.procrustes.R . lines.radline.R . lines.spantree.R . linestack.R . make.cepnames.R . make.commsim.R . mantel.R . mantel.correlog.R . mantel.partial.R . meandist.R . metaMDS.R . metaMDSdist.R . metaMDSiter.R . metaMDSredist.R . model.frame.cca.R . model.matrix.cca.R . monoMDS.R . mrpp.R . mso.R . msoplot.R . multipart.R . multipart.default.R . multipart.formula.R . nestedbetasor.R . nestedchecker.R . nesteddisc.R . nestedn0.R . nestednodf.R . nestedtemp.R . no.shared.R . nobs.R . nullmodel.R . oecosimu.R . ordConstrained.R . orderingKM.R . ordiArgAbsorber.R . ordiArrowMul.R . ordiArrowTextXY.R . ordiNAexclude.R . ordiParseFormula.R . ordiR2step.R . ordiTerminfo.R . ordiYbar.R . ordiareatest.R . ordiarrows.R . ordibar.R . ordicloud.R . ordicluster.R . ordiellipse.R . ordigrid.R . ordihull.R . ordilabel.R . ordilattice.getEnvfit.R . ordimedian.R . ordiplot.R . ordipointlabel.R . ordiresids.R . ordisegments.R . ordispider.R . ordisplom.R . ordistep.R . ordisurf.R . orditkplot.R . orditorp.R . ordixyplot.R . panel.ordi.R . panel.ordi3d.R . pasteCall.R . pcnm.R . permatfull.R . permatswap.R . permustats.R . permutest.betadisper.R . permutest.cca.R . persp.renyiaccum.R . persp.tsallisaccum.R . plot.MOStest.R . plot.anosim.R . plot.betadisper.R . plot.betadiver.R . plot.cascadeKM.R . plot.cca.R . plot.clamtest.R . plot.contribdiv.R . plot.decorana.R . plot.envfit.R . plot.fisherfit.R . plot.isomap.R . plot.mantel.correlog.R . plot.meandist.R . plot.metaMDS.R . plot.nestedtemp.R . plot.ordipointlabel.R . plot.ordisurf.R . plot.orditkplot.R . plot.permat.R . plot.poolaccum.R . plot.prc.R . plot.preston.R . plot.prestonfit.R . plot.procrustes.R . plot.rad.R . plot.radfit.R . plot.radfit.frame.R . plot.radline.R . plot.renyi.R . plot.renyiaccum.R . plot.spantree.R . plot.specaccum.R . plot.taxondive.R . plot.varpart.R . plot.varpart234.R . points.cca.R . points.decorana.R . points.metaMDS.R . points.ordiplot.R . points.orditkplot.R . points.procrustes.R . points.radline.R . poolaccum.R . postMDS.R . prc.R . predict.cca.R . predict.decorana.R . predict.fitspecaccum.R . predict.humpfit.R . predict.radline.R . predict.rda.R . predict.specaccum.R . pregraphKM.R . prepanel.ordi3d.R . prestondistr.R . prestonfit.R . print.CCorA.R . print.MOStest.R . print.anosim.R . print.betadisper.R . print.bioenv.R . print.cca.R . print.commsim.R . print.decorana.R . print.envfit.R . print.factorfit.R . print.fisherfit.R . print.isomap.R . print.mantel.R . print.mantel.correlog.R . print.metaMDS.R . print.monoMDS.R . print.mrpp.R . print.mso.R . print.nestedchecker.R . print.nesteddisc.R . print.nestedn0.R . print.nestednodf.R . print.nestedtemp.R . print.nullmodel.R . print.oecosimu.R . print.permat.R . print.permutest.betadisper.R . print.permutest.cca.R . print.poolaccum.R . print.prestonfit.R . print.procrustes.R . print.protest.R . print.radfit.R . print.radfit.frame.R . print.radline.R . print.simmat.R . print.specaccum.R . print.summary.bioenv.R . print.summary.cca.R . print.summary.clamtest.R . print.summary.decorana.R . print.summary.isomap.R . print.summary.meandist.R . print.summary.permat.R . print.summary.prc.R . print.summary.procrustes.R . print.summary.taxondive.R . print.taxondive.R . print.varpart.R . print.varpart234.R . print.vectorfit.R . print.wcmdscale.R . procrustes.R . profile.MOStest.R . profile.humpfit.R . protest.R . rad.lognormal.R . rad.null.R . rad.preempt.R . rad.zipf.R . rad.zipfbrot.R . radfit.R . radfit.data.frame.R . radfit.default.R . radlattice.R . rankindex.R . rarecurve.R . rarefy.R . rareslope.R . raupcrick.R . rda.R . rda.default.R . rda.formula.R . read.cep.R . renyi.R . renyiaccum.R . residuals.cca.R . residuals.procrustes.R . rrarefy.R . scalingUtils.R . scores.R . scores.betadisper.R . scores.betadiver.R . scores.cca.R . scores.decorana.R . scores.default.R . scores.envfit.R . scores.lda.R . scores.metaMDS.R . scores.ordihull.R . scores.ordiplot.R . scores.orditkplot.R . scores.pcnm.R . scores.rda.R . screeplot.cca.R . screeplot.decorana.R . screeplot.prcomp.R . screeplot.princomp.R . showvarparts.R . simper.R . simpleRDA2.R . simpson.unb.R . simulate.nullmodel.R . simulate.rda.R . smbind.R . spandepth.R . spantree.R . specaccum.R . specnumber.R . specpool.R . specpool2vect.R . specslope.R . spenvcor.R . sppscores.R . stepacross.R . str.nullmodel.R . stressplot.R . stressplot.wcmdscale.R . summary.anosim.R . summary.bioenv.R . summary.cca.R . summary.clamtest.R . summary.decorana.R . summary.dispweight.R . summary.isomap.R . summary.meandist.R . summary.ordiellipse.R . summary.ordihull.R . summary.permat.R . summary.poolaccum.R . summary.prc.R . summary.procrustes.R . summary.radfit.frame.R . summary.specaccum.R . summary.taxondive.R . summary.varpart.R . swan.R . tabasco.R . taxa2dist.R . taxondive.R . text.cca.R . text.decorana.R . text.metaMDS.R . text.ordiplot.R . text.orditkplot.R . toCoda.R . tolerance.R . tolerance.cca.R . tolerance.decorana.R . treedist.R . treedive.R . treeheight.R . tsallis.R . tsallisaccum.R . update.nullmodel.R . varpart.R . varpart2.R . varpart3.R . varpart4.R . vectorfit.R . vegan-defunct.R . vegan-deprecated.R . veganCovEllipse.R . veganMahatrans.R . vegandocs.R . vegdist.R . vegemite.R . veiledspec.R . vif.cca.R . wascores.R . wcmdscale.R . weights.cca.R . weights.decorana.R . weights.rda.R . wisconsin.R . zzz.R .  Full vegan package functions and examples
Downloads during the last 30 days
12/1012/1112/1212/1312/1412/1512/1612/1712/1812/1912/2012/2112/2212/2312/2412/2512/2612/2712/2812/2912/3012/3101/0101/0201/0301/0401/0501/0601/0701/08Downloads for vegan100020003000400050006000700080009000TrendBars
Get rewarded with contribution points by helping add
Reviews / comments / questions /suggestions ↴↴↴

Today's Hot Picks in Authors and Packages

r2resize  
In-Text Resize for Images, Tables and Fancy Resize Containers in 'shiny', 'rmarkdown' and 'quarto' Documents
Automatic resizing toolbar for containers, images and tables. Various resizable or expandable contai ...
Download / Learn more Package Citations See dependency  
dbstats  
Distance-Based Statistics
Prediction methods where explanatory information is coded as a matrix of distances between individua ...
Download / Learn more Package Citations See dependency  
ggdmc  
Cognitive Models
Hierarchical Bayesian models. The package provides tools to fit two response time models, using the ...
Download / Learn more Package Citations See dependency  
RonFHIR  
Read and Search Interface to the 'HL7 FHIR' REST API
R on FHIR is an easy to use wrapper around the 'HL7 FHIR' REST API (STU 3 and R4). It provides tools ...
Download / Learn more Package Citations See dependency  
ordinalRR  
Analysis of Repeatability and Reproducibility Studies with Ordinal Measurements
Implements Bayesian data analyses of balanced repeatability and reproducibility studies with ordinal ...
Download / Learn more Package Citations See dependency  
zoo  
S3 Infrastructure for Regular and Irregular Time Series (Z's Ordered Observations)
An S3 class with methods for totally ordered indexed observations. It is particularly aimed at irre ...
Download / Learn more Package Citations See dependency  

23,440

R Packages

202,297

Dependencies

63,567

Author Associations

23,441

Publication Badges

© Copyright since 2022. All right reserved, rpkg.net.  Based in Cambridge, Massachusetts, USA