Other packages > Find by keyword >

aroma.affymetrix  

Analysis of Large Affymetrix Microarray Data Sets
View on CRAN: Click here


Download and install aroma.affymetrix package within the R console
Install from CRAN:
install.packages("aroma.affymetrix")

Install from Github:
library("remotes")
install_github("cran/aroma.affymetrix")

Install by package version:
library("remotes")
install_version("aroma.affymetrix", "3.2.2")



Attach the package and use:
library("aroma.affymetrix")
Maintained by
Henrik Bengtsson
[Scholar Profile | Author Map]
First Published: 2009-06-29
Latest Update: 2024-02-18
Description:
A cross-platform R framework that facilitates processing of any number of Affymetrix microarray samples regardless of computer system. The only parameter that limits the number of chips that can be processed is the amount of available disk space. The Aroma Framework has successfully been used in studies to process tens of thousands of arrays. This package has actively been used since 2006.
How to cite:
Henrik Bengtsson (2009). aroma.affymetrix: Analysis of Large Affymetrix Microarray Data Sets. R package version 3.2.2, https://cran.r-project.org/web/packages/aroma.affymetrix. Accessed 06 Apr. 2025.
Previous versions and publish date:
1.1.1 (2009-06-29 20:32), 1.2.0 (2009-09-10 11:52), 1.3.0 (2009-11-03 12:26), 1.4.0 (2010-01-07 16:41), 1.5.0 (2010-02-23 12:30), 1.6.0 (2010-05-16 18:15), 1.7.0 (2010-07-26 13:49), 1.8.0 (2010-11-08 08:29), 1.9.0 (2011-01-10 15:37), 2.0.0 (2011-02-17 14:07), 2.1.0 (2011-04-09 11:28), 2.1.6 (2011-08-02 08:15), 2.1.8 (2011-08-29 19:37), 2.2.0 (2011-09-03 06:48), 2.3.0 (2011-11-02 18:25), 2.4.0 (2012-01-12 17:32), 2.5.0 (2012-03-26 08:06), 2.6.0 (2012-09-06 07:27), 2.7.0 (2012-11-26 08:51), 2.8.0 (2012-12-22 10:47), 2.9.0 (2013-05-03 08:22), 2.10.0 (2013-08-06 07:39), 2.11.1 (2013-10-18 19:56), 2.12.0 (2014-03-10 00:30), 2.13.0 (2015-01-20 12:41), 2.13.2 (2015-05-27 08:55), 2.14.0 (2015-10-25 08:55), 3.0.0 (2016-01-10 00:00), 3.1.0 (2017-03-24 06:37), 3.1.1 (2018-04-16 20:53), 3.2.0 (2019-06-23 08:00), 3.2.1 (2022-07-18 12:50)
Other packages that cited aroma.affymetrix R package
View aroma.affymetrix citation profile
Other R packages that aroma.affymetrix depends, imports, suggests or enhances
Complete documentation for aroma.affymetrix
Functions, R codes and Examples using the aroma.affymetrix R package
Some associated functions: AbstractProbeSequenceNormalization . AdditiveCovariatesNormalization . AffineCnPlm . AffinePlm . AffineSnpPlm . AffymetrixCdfFile . AffymetrixCelFile . AffymetrixCelSet . AffymetrixCelSetReporter . AffymetrixCelSetTuple . AffymetrixCnChpSet . AffymetrixFile . AffymetrixFileSet . AffymetrixFileSetReporter . AffymetrixPgfFile . AffymetrixProbeTabFile . AlleleSummation . AllelicCrosstalkCalibration . AromaChipTypeAnnotationFile . ArrayExplorer . AvgCnPlm . AvgPlm . AvgSnpPlm . BackgroundCorrection . BaseCountNormalization . BasePositionNormalization . ChipEffectFile . ChipEffectGroupMerge . ChipEffectSet . ChipEffectTransform . CnChipEffectFile . CnChipEffectSet . CnPlm . CnProbeAffinityFile . CnagCfhFile . CnagCfhSet . CrlmmParametersFile . CrlmmParametersSet . DChipCdfBinFile . DChipDcpFile . DChipDcpSet . DChipGenomeInformation . DChipQuantileNormalization . DChipSnpInformation . ExonChipEffectFile . ExonChipEffectSet . ExonProbeAffinityFile . ExonRmaPlm . FirmaFile . FirmaModel . FirmaSet . FragmentEquivalentClassNormalization . FragmentLengthNormalization . GcContentNormalization . GcContentNormalization2 . GcRmaBackgroundCorrection . GenericReporter . GenomeInformation . HetLogAddCnPlm . HetLogAddPlm . HetLogAddSnpPlm . LimmaBackgroundCorrection . LinearModelProbeSequenceNormalization . MatNormalization . MatSmoothing . MbeiCnPlm . MbeiPlm . MbeiSnpPlm . Model . MultiArrayUnitModel . Non-documented_objects . NormExpBackgroundCorrection . OpticalBackgroundCorrection . ParameterCelFile . ParameterCelSet . ProbeAffinityFile . ProbeLevelModel . ProbeLevelTransform . ProbeLevelTransform3 . QualityAssessmentFile . QualityAssessmentModel . QualityAssessmentSet . QuantileNormalization . ReseqCrosstalkCalibration . ResidualFile . ResidualSet . RmaBackgroundCorrection . RmaCnPlm . RmaPlm . RmaSnpPlm . ScaleNormalization . ScaleNormalization3 . SingleArrayUnitModel . SmoothMultiarrayModel . SmoothRmaModel . SnpChipEffectFile . SnpChipEffectGroupMerge . SnpChipEffectSet . SnpInformation . SnpPlm . SnpProbeAffinityFile . SpatialReporter . TransformReport . UgpGenomeInformation . UnitModel . UnitTypeScaleNormalization . WeightsFile . WeightsSet . allocateFromCdf.AffymetrixCelFile . allocateFromCdf.AromaUnitTabularBinaryFile . aroma.affymetrix-package . as.AffymetrixCelSet.AffymetrixCelSet . as.AffymetrixCnChpSet.AffymetrixCnChpSet . as.AffymetrixFileSet.AffymetrixFileSet . as.CnagCfhSet.CnagCfhSet . as.DChipDcpSet.DChipDcpSet . as.character.AffymetrixCelSet . as.character.AffymetrixCnChpSet . as.character.CnagCfhSet . as.character.DChipDcpSet . averageQuantile.AffymetrixCelSet . bpmapCluster2Cdf . byChipType.AromaChipTypeAnnotationFile . byChipType.DChipGenomeInformation . byChipType.DChipSnpInformation . byChipType.GenomeInformation . byChipType.SnpInformation . byChipType.UgpGenomeInformation . byPath.AffymetrixFileSet . calculateBaseline.ChipEffectSet . calculateParametersGsb.AffymetrixCelSet . calculateResidualSet.FirmaModel . clearData.AffymetrixCelFile . compare.AffymetrixCdfFile . computeAffinities.AffymetrixCdfFile . convert.AffymetrixCdfFile . convertUnits.AffymetrixCdfFile . createExonByTranscriptCdf.AffymetrixCdfFile . createFrom.AffymetrixCelFile . createMonocellCdf.AffymetrixCdfFile . createUniqueCdf.AffymetrixCdfFile . doCRMAv1 . doCRMAv2 . doFIRMA . doGCRMA . doRMA . extractAffyBatch.AffymetrixCelSet . extractDataFrame.ParameterCelSet . extractExpressionSet.ChipEffectSet . extractFeatureSet.AffymetrixCelSet . extractMatrix.AffymetrixCelSet . extractMatrix.ParameterCelSet . findByChipType.AffymetrixCdfFile . findByChipType.AffymetrixPgfFile . findByChipType.AromaChipTypeAnnotationFile . findUnitsTodo.FirmaModel . findUnitsTodo.ProbeLevelModel . findUnitsTodo.UnitModel . fit.FirmaModel . fit.Model . fit.ProbeLevelModel . fit.SingleArrayUnitModel . fit.SmoothMultiarrayModel . fitQuantileNormFcn.AffymetrixCelFile . fromCdf.GenomeInformation . fromCdf.SnpInformation . fromDataFile.ChipEffectFile . fromFile.AffymetrixCdfFile . fromFile.AffymetrixCelFile . fromFile.AffymetrixPgfFile . fromFile.AromaChipTypeAnnotationFile . fromFile.CnagCfhFile . getAM.ChipEffectFile . getAM.ChipEffectSet . getAlias.GenericReporter . getAlias.Model . getAlleleCellPairs.AffymetrixCdfFile . getAlleleProbePairs.AffymetrixCdfFile . getAlleleProbePairs3.AffymetrixCdfFile . getAverageFile.AffymetrixCelSet . getAverageFile.CnagCfhSet . getBaseline.ChipEffectSet . getCdf.AffymetrixCelFile . getCdf.AffymetrixCelSet . getCdf.CnagCfhFile . getCdf.CnagCfhSet . getCdf.Model . getCellIndices.AffymetrixCdfFile . getCellIndices.ChipEffectFile . getCellIndices.CnChipEffectFile . getCellIndices.CnProbeAffinityFile . getCellIndices.ExonChipEffectFile . getCellIndices.ExonProbeAffinityFile . getCellIndices.FirmaFile . getCellIndices.ProbeAffinityFile . getCellIndices.ResidualFile . getCellIndices.SnpChipEffectFile . getCellIndices.SnpProbeAffinityFile . getCellIndices.UnitModel . getCellIndices.WeightsFile . getChipEffectSet.AlleleSummation . getChipEffectSet.ProbeLevelModel . getChipType.AffymetrixCelFile . getChipType.AffymetrixCelSet . getChipType.CnagCfhFile . getChipType.GenomeInformation . getChipType.SnpInformation . getCnNames.AffymetrixCdfFile . getData.GenomeInformation . getData.SnpInformation . getDataSet.AffymetrixCelSetReporter . getDataSet.ArrayExplorer . getDataSet.Model . getFirmaSet.FirmaModel . getFitUnitGroupFunction.AffinePlm . getFitUnitGroupFunction.AvgPlm . getFitUnitGroupFunction.ExonRmaPlm . getFitUnitGroupFunction.FirmaModel . getFitUnitGroupFunction.HetLogAddPlm . getFitUnitGroupFunction.MbeiPlm . getFitUnitGroupFunction.MultiArrayUnitModel . getFitUnitGroupFunction.RmaPlm . getFitUnitGroupFunction.SingleArrayUnitModel . getFullName.Model . getFullName.TransformReport . getGenomeInformation.AffymetrixCdfFile . getHeader.AffymetrixCdfFile . getHeader.AffymetrixCelFile . getHeader.AffymetrixPgfFile . getHeader.AromaChipTypeAnnotationFile . getHeader.CnagCfhFile . getImage.AffymetrixCelFile . getInputDataSet.TransformReport . getIntensities.AffymetrixCelSet . getName.GenericReporter . getName.Model . getName.TransformReport . getOutputDataSet.Transform . getOutputDataSet.TransformReport . getPath.Model . getPath.TransformReport . getPositions.GenomeInformation . getProbeAffinityFile.ProbeLevelModel . getResiduals.QualityAssessmentModel . getRootPath.Model . getSnpNames.AffymetrixCdfFile . getTags.GenericReporter . getTags.Model . getTags.TransformReport . getTimestamp.AffymetrixCelFile . getUnitGroupCellMap.ChipEffectFile . getUnitIndices.GenomeInformation . getUnitIntensities.AffymetrixCelSet . getUnitNames.AffymetrixCdfFile . getUnitNames.AffymetrixPgfFile . getUnitTypes.AffymetrixCdfFile . getWeights.QualityAssessmentModel . getXAM.ChipEffectFile . getXAM.ChipEffectSet . groupUnitsByDimension.AffymetrixCdfFile . image270.AffymetrixCelFile . importFromApt.CnChipEffectSet . importFromDChip.AffymetrixCelSet . importFromDChip.CnChipEffectSet . isDuplicated.AffymetrixCelSet . isDuplicated.CnagCfhSet . isPm.AffymetrixCdfFile . isResequenceChip.AffymetrixCdfFile . isSnpChip.AffymetrixCdfFile . justRMA . nbrOfArrays.AffymetrixCelSet . nbrOfGroupsPerUnit.AffymetrixCdfFile . nbrOfSnps.AffymetrixCdfFile . normalizeQuantile.AffymetrixCelFile . normalizeQuantile.AffymetrixCelSet . pdInfo2Cdf . plotBoxplotStats.list . plotDensity.AffymetrixCelFile . plotDensity.AffymetrixCelSet . plotDensity.GenomeInformation . plotImage.AffymetrixCelFile . plotMvsA.AffymetrixCelFile . plotMvsX.AffymetrixCelFile . process.AbstractProbeSequenceNormalization . process.AdditiveCovariatesNormalization . process.AllelicCrosstalkCalibration . process.ArrayExplorer . process.BackgroundCorrection . process.ChipEffectGroupMerge . process.DChipQuantileNormalization . process.FragmentEquivalentClassNormalization . process.FragmentLengthNormalization . process.GcContentNormalization . process.GcRmaBackgroundCorrection . process.GenericReporter . process.LimmaBackgroundCorrection . process.MatNormalization . process.MatSmoothing . process.OpticalBackgroundCorrection . process.QuantileNormalization . process.ReseqCrosstalkCalibration . process.RmaBackgroundCorrection . process.ScaleNormalization . process.ScaleNormalization3 . process.SpatialReporter . process.UnitTypeScaleNormalization . randomSeed . readRawData.AffymetrixCelFile . readUnits.AffymetrixCdfFile . readUnits.AffymetrixCelFile . readUnits.CnagCfhFile . readUnits.MultiArrayUnitModel . readUnits.SingleArrayUnitModel . readUnitsByQuartets.AffymetrixCdfFile . setAlias.GenericReporter . setAlias.Model . setArrays.ArrayExplorer . setCdf.AffymetrixCelFile . setCdf.AffymetrixCelSet . setCdf.CnagCfhFile . setCdf.CnagCfhSet . setRestructor.AffymetrixCdfFile . setTags.Model . setupExampleData.AromaAffymetrix . setupExampleData . smoothScatterMvsA.AffymetrixCelFile . updateUnits.AffymetrixCelFile . verify.GenomeInformation . verify.SnpInformation . writeCdf.AffyGenePDInfo . writeImage.AffymetrixCelFile . 
Some associated R codes: 000.R . 006.fixVarArgs.R . 009.setup.R . 021.dynamic_imports.R . 999.AromaAffymetrix.R . 999.DEPRECATED.R . 999.NonDocumentedObjects.R . 999.package.R . ASCRMAv2.R . AbstractProbeSequenceNormalization.R . AdditiveCovariatesNormalization.R . AffineCnPlm.R . AffinePlm.R . AffineSnpPlm.R . AffyGenePDInfo.writeCdf.R . AffymetrixAptSummaryFile.R . AffymetrixCdfFile.COUNTS.R . AffymetrixCdfFile.MONOCELL.R . AffymetrixCdfFile.PLOT.R . AffymetrixCdfFile.R . AffymetrixCdfFile.SNPs.R . AffymetrixCdfFile.UNIQUE.R . AffymetrixCdfFile.computeAffinities.R . AffymetrixCdfFile.getAlleleCellPairs.R . AffymetrixCdfFile.getAlleleProbePairs.R . AffymetrixCdfFile.getAlleleProbePairs2.R . AffymetrixCdfFile.getAlleleProbePairs3.R . AffymetrixCdfFile.getCellQuartets.R . AffymetrixCdfFile.getProbeSequenceData.R . AffymetrixCdfFile.getSubsetOfCellIndices.R . AffymetrixCdfFile.getSubsetOfUnits.R . AffymetrixCdfFile.getUnitGroupCellMap.R . AffymetrixCdfFile.getUnitGroupNamesFromUgcMap.R . AffymetrixCdfFile.groupUnitsByDimension.R . AffymetrixCdfFile.readDataFrame.R . AffymetrixCdfFile.writeCdfByExcludingCells.R . AffymetrixCelFile.BG.R . AffymetrixCelFile.PLOT.R . AffymetrixCelFile.R . AffymetrixCelFile.allocateFromCdf.R . AffymetrixCelFile.createFrom.R . AffymetrixCelFile.extractMatrix.R . AffymetrixCelFile.fitQuantileNormFcn.R . AffymetrixCelFile.normalizeAffine.R . AffymetrixCelFile.normalizeQuantile.R . AffymetrixCelSet.BG.R . AffymetrixCelSet.NORM.R . AffymetrixCelSet.PLOT.R . AffymetrixCelSet.R . AffymetrixCelSet.convertToUnique.R . AffymetrixCelSet.extractAffyBatch.R . AffymetrixCelSet.extractFeatureSet.R . AffymetrixCelSet.extractMatrix.R . AffymetrixCelSet.getAverageFile.R . AffymetrixCelSet.importFromDChip.R . AffymetrixCelSet.justSNPRMA.R . AffymetrixCelSet.writeSgr.R . AffymetrixCelSetReporter.R . AffymetrixCelSetTuple.R . AffymetrixCnChpFile.R . AffymetrixCnChpSet.R . AffymetrixCnChpSet.extras.R . AffymetrixCsvFile.R . AffymetrixCsvGenomeInformation.R . AffymetrixFile.R . AffymetrixFileSet.R . AffymetrixFileSet.getIdentifier.R . AffymetrixFileSetReporter.R . AffymetrixNetAffxCsvFile.R . AffymetrixNetAffxCsvFile.XTRS.R . AffymetrixPgfFile.R . AffymetrixPlatform.R . AffymetrixProbeTabFile.R . AffymetrixTabularFile.R . AffymetrixTsvFile.R . AlleleSummation.R . AllelicCrosstalkCalibration.PLOT.R . AllelicCrosstalkCalibration.R . AllelicCrosstalkCalibration.getSetsOfProbes.R . AromaCellCpgFile.AFFX.R . AromaCellMatchScoreFile.AFFX.R . AromaCellMatchScoreFile.R . AromaCellMatchScoreFile.importFromBpmap.R . AromaCellPositionFile.AFFX.R . AromaCellSequenceFile.AFFX.R . AromaCellSequenceFile.importFromBpmap.R . AromaChipTypeAnnotationFile.R . AromaPipeline.R . AromaUfcFile.R . AromaUflFile.AFFX.R . AromaUgpFile.AFFX.R . AromaUnitGcContentFile.AFFX.R . AromaUnitTabularBinaryFile.AFFX.PLOT.R . AromaUnitTabularBinaryFile.AFFX.R . ArrayExplorer.R . AvgCnPlm.R . AvgPlm.R . AvgSnpPlm.R . BackgroundCorrection.R . BaseCountNormalization.R . BasePositionNormalization.R . BasePositionNormalization.getFit.R . ChipEffectFile.R . ChipEffectFile.TOFULL.R . ChipEffectFile.extractTheta.R . ChipEffectFile.fromDataFile.R . ChipEffectFile.getUnitGroupCellMatrixMap.R . ChipEffectFile.xam.R . ChipEffectGroupMerge.R . ChipEffectNnn.extractChromosomalDataFrame.R . ChipEffectSet.PLOT.R . ChipEffectSet.R . ChipEffectSet.STATS.R . ChipEffectSet.TOFULL.R . ChipEffectSet.calculateBaseline.R . ChipEffectSet.extractExpressionSet.R . ChipEffectSet.extractTheta.R . ChipEffectSet.getBaseline.R . ChipEffectSet.xam.R . ChipEffectSetTuple.R . ChipEffectTransform.R . ChromosomalModel.AFFX.R . ChromosomalModel.getPositionChipTypeUnit.R . ChromosomalModel.getXTheta.R . CnChipEffectFile.R . CnChipEffectFile.exportAromaSignalBinaryFileList.R . CnChipEffectSet.R . CnChipEffectSet.importFromApt.R . CnChipEffectSet.importFromDChip.R . CnChipEffectSet.writeWig.R . CnChipEffectSetTuple.R . CnPlm.R . CnProbeAffinityFile.R . CnagCfhFile.R . CnagCfhSet.R . CopyNumberChromosomalModel.applyCCF.R . CopyNumberSegmentationModel.migrateTool.R . CrlmmModel.EXT.R . CrlmmModel.R . CrlmmParametersFile.R . CrlmmParametersSet.R . DChipCdfBinFile.R . DChipCdfBinFile.mapToUnitNamesFile.R . DChipDcpFile.R . DChipDcpSet.R . DChipDcpSet.extras.R . DChipGenomeInformation.R . DChipQuantileNormalization.R . DChipSnpInformation.R . ExonChipEffectFile.R . ExonChipEffectSet.R . ExonProbeAffinityFile.R . ExonRmaPlm.R . ExonRmaPlm.calculateWeights.R . FirmaFile.R . FirmaModel.R . FirmaSet.R . FragmentEquivalentClassNormalization.R . FragmentLengthNormalization.R . GcContentNormalization.R . GcContentNormalization2.R . GcContentNormalization2.plotCovariateEffects.R . GcRmaBackgroundCorrection.R . GenericReporter.R . GenomeInformation.AFFX.R . GenomeInformation.R . HetLogAddCnPlm.R . HetLogAddPlm.R . HetLogAddSnpPlm.R . LimmaBackgroundCorrection.R . LinearModelProbeSequenceNormalization.R . MatNormalization.R . MatSmoothing.R . MbeiCnPlm.R . MbeiPlm.R . MbeiSnpPlm.R . Model.R . MultiArrayUnitModel.R . NormExpBackgroundCorrection.R . OpticalBackgroundCorrection.R . Package.XTRA.R . ParameterCelFile.R . ParameterCelFile.extractNnn.R . ParameterCelSet.R . ProbeAffinityFile.R . ProbeLevelModel.R . ProbeLevelModel.calculateResiduals.R . ProbeLevelModel.calculateWeights.R . ProbeLevelModel.fit.R . ProbeLevelTransform.R . ProbeLevelTransform3.R . QualityAssessmentFile.R . QualityAssessmentModel.R . QualityAssessmentSet.R . QuantileNormalization.R . QuantileNormalization.xtra.R . ReseqCrosstalkCalibration.R . ResidualFile.R . ResidualSet.R . RmaBackgroundCorrection.R . RmaCnPlm.R . RmaPlm.R . RmaSnpPlm.R . ScaleNormalization.R . ScaleNormalization3.R . SingleArrayUnitModel.R . SingleArrayUnitModel.fit.R . SmoothMultiarrayModel.R . SmoothMultiarrayModel.fit.R . SmoothRmaModel.R . SmoothSaModel.R . SnpChipEffectFile.R . SnpChipEffectFile.exportTotalAndFracB.R . SnpChipEffectFile.extractTotalAndFracB.R . SnpChipEffectGroupMerge.R . SnpChipEffectNnn.extractCNT.R . SnpChipEffectNnn.writeCNT.R . SnpChipEffectSet.R . SnpChipEffectSet.exportTotalAndFracB.R . SnpChipEffectSet.extractAlleleSet.R . SnpChipEffectSet.extractSnpCnvQSet.R . SnpChipEffectSet.extractSnpQSet.R . SnpChipEffectSet.extractTotalAndFreqB.R . SnpCnvQSet.extractTheta.R . SnpInformation.R . SnpPlm.R . SnpProbeAffinityFile.R . SnpQSet.extractTheta.R . SpatialReporter.R . SpatialRowColumnNormalization.R . Transform.R . TransformReport.R . UflSnpInformation.R . UgpGenomeInformation.R . UnitModel.R . UnitModel.fitCnProbes.R . UnitTypeScaleNormalization.R . WeightsFile.R . WeightsSet.R . bpmapCluster2Cdf.R . createExonByTranscriptCdf.R . doCRMAv1.R . doCRMAv2.R . doFIRMA.R . doGCRMA.R . doRMA.R . dropCellsFromCdfList.R . env2Cdf.R . findByCdf2.R . fitPlasqUnit.R . getPlasqTypes.R . isUnitGroupCellMap.R . justRMA.R . pdInfo2Cdf.R . plotBoxplotStats.list.R . profileCGH.getRegions.R . profileCGH.writeRegions.R . randomSeed.R . readCdfGroupStrands.R . readCfhHeader.R . readCfhUnits.R . readCfnHeader.R . readCfnUnits.R . setCustomFindCdf.R . setupExampleData.R . zzz.R .  Full aroma.affymetrix package functions and examples
Downloads during the last 30 days
03/0703/0803/0903/1003/1103/1203/1303/1403/1503/1603/1703/1803/1903/2003/2103/2203/2303/2403/2503/2603/2703/2803/2903/3003/3104/0104/0204/0304/04Downloads for aroma.affymetrix0102030405060708090TrendBars

Today's Hot Picks in Authors and Packages

listarrays  
A Toolbox for Working with R Arrays in a Functional Programming Style
A toolbox for R arrays. Flexibly split, bind, reshape, modify, subset and name arrays. ...
Download / Learn more Package Citations See dependency  
ider  
Various Methods for Estimating Intrinsic Dimension
An implementation of various methods for estimating intrinsic dimension of vector-valued dataset or ...
Download / Learn more Package Citations See dependency  
FuzzyQ  
Fuzzy Quantification of Common and Rare Species
Fuzzy clustering of species in an ecological community as common or rare based on their abundance a ...
Download / Learn more Package Citations See dependency  
danstat  
R Client for the Statistics Denmark Databank API
The purpose of the package is to enable an R function interface into the Statistics Denmark Databank ...
Download / Learn more Package Citations See dependency  
r2resize  
In-Text Resize for Images, Tables and Fancy Resize Containers in 'shiny', 'rmarkdown' and 'quarto' Documents
Automatic resizing toolbar for containers, images and tables. Various resizable or expandable contai ...
Download / Learn more Package Citations See dependency  
spCP  
Spatially Varying Change Points
Implements a spatially varying change point model with unique intercepts, slopes, variance intercep ...
Download / Learn more Package Citations See dependency  

23,990

R Packages

207,311

Dependencies

64,809

Author Associations

23,991

Publication Badges

© Copyright since 2022. All right reserved, rpkg.net.  Based in Cambridge, Massachusetts, USA